Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D8Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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