Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lin37Q9D8N6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms