Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lamp5Q9D387 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lamp5Q9D387 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms