Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BccipQ9CWI3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BccipQ9CWI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms