Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab5aQ9CQD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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