Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4930519G04RikQ9CPT7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms