Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRNKL1Q9BZJ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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