Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMM29Q9BSF4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TIMM29Q9BSF4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms