Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTV1Q96GA3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTV1Q96GA3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms