Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC97Q96F63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms