Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Sh3bp4Q921I6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bp4Q921I6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Sh3bp4Q921I6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Sh3bp4Q921I6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sh3bp4Q921I6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms