Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rhbdd2Q8VEK2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms