Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RfxapQ8VCG9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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