Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc9Q8VC31 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc9Q8VC31 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms