Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB1

LNX1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1Q8TBB1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LNX1Q8TBB1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LNX1Q8TBB1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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