Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vma21Q78T54 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Vma21Q78T54 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Vma21Q78T54 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Vma21Q78T54 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Vma21Q78T54 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Vma21Q78T54 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vma21Q78T54 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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