Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn9aQ62205 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn9aQ62205 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn9aQ62205 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms