Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SOGA3Q5TF21 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOGA3Q5TF21 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOGA3Q5TF21 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms