Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtp3Q5QGU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms