Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc102aQ3TMW1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc102aQ3TMW1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms