Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhox4cQ2MDG1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms