Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SREBF2Q12772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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