Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a1Q05722 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a1Q05722 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms