Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALD1Q05682 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALD1Q05682 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms