Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scn1bP97952 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms