Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pkp1P97350 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pkp1P97350 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms