Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ufd1P70362 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufd1P70362 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms