Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKP1P63208 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKP1P63208 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKP1P63208 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKP1P63208 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms