Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps27aP62983 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps27aP62983 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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