Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR2LP62875 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2LP62875 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms