Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lsm5P62322 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lsm5P62322 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms