Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA9P57773 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA9P57773 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA9P57773 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA9P57773 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA9P57773 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms