Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Samsn1P57725 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms