Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Cldn18P56857 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn18P56857 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms