Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ClgnP52194 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ClgnP52194 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms