Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prox1P48437 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prox1P48437 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms