Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CLIP1P30622 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CLIP1P30622 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms