Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 HIT1YJR055W 495 nt5.33□□□□□ -1.56
UBP1P25037 AIM26YKL037W 357 nt5.33□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RPL22AYLR061W 366 nt5.33□□□□□ -1.56
UBP1P25037 CDC9YDL164C 2268 nt5.33□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YGR266WYGR266W 2106 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 ORC6YHR118C 1308 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 SAE2YGL175C 1038 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 REE1YJL217W 597 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 LSO1YJR005C-A 282 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 AIM29YKR074W 468 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 CTK3YML112W 891 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 snR54snR54 86 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 LRG1YDL240W 3054 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 ARO80YDR421W 2853 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YGR125WYGR125W 3111 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 KCC4YCL024W 3114 nt5.32□□□□□ -1.56
UBP1P25037 MSE1YOL033W 1611 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YRB30YGL164C 1323 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 SDS23YGL056C 1584 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 CNL1YDR357C 369 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 GPI19YDR437W 423 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RPL28YGL103W 450 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 HTA2YBL003C 399 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YNL089CYNL089C 477 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YNL150WYNL150W 408 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 TPK2YPL203W 1143 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 TGL4YKR089C 2733 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 MON1YGL124C 1935 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 MSC2YDR205W 2175 nt5.31□□□□□ -1.56
UBP1P25037 KIN3YAR018C 1308 nt5.3□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YER034WYER034W 558 nt5.3□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RPS1BYML063W 768 nt5.3□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RAD16YBR114W 2373 nt5.3□□□□□ -1.56
UBP1P25037 TCB3YML072C 4638 nt5.3□□□□□ -1.56
UBP1P25037 FAR8YMR029C 1572 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 VHR1YIL056W 1923 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 HNT1YDL125C 477 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 LSB1YGR136W 726 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RTS3YGR161C 792 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 PIR1YKL164C 1026 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 PAI3YMR174C 207 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 HIS4YCL030C 2400 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 VHC1YBR235W 3363 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 SFI1YLL003W 2841 nt5.29□□□□□ -1.56
UBP1P25037 JHD2YJR119C 2187 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 TPO2YGR138C 1845 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 RSC6YCR052W 1452 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 PRS5YOL061W 1491 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 YDR230WYDR230W 348 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 GOS1YHL031C 672 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 DPH1YIL103W 1278 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 NNF1YJR112W 606 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 CSE4YKL049C 690 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 AIM4YBR194W 372 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 TPD3YAL016W 1908 nt5.28□□□□□ -1.56
UBP1P25037 WHI3YNL197C 1986 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 KIN4YOR233W 2403 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 GAL80YML051W 1308 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 NNT1YLR285W 786 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YML108WYML108W 318 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 FYV5YCL058C 459 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YMR221CYMR221C 1515 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 UBP10YNL186W 2379 nt5.27□□□□□ -1.57
UBP1P25037 BLM10YFL007W 6432 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 FUS2YMR232W 2034 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 RIM4YHL024W 2142 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YGL108CYGL108C 423 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 FYV4YHR059W 393 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 BIG1YHR101C 1008 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 SPC1YJR010C-A 285 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 SOD1YJR104C 465 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 DAD2YKR083C 402 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YMR087WYMR087W 855 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 TDA7YNL176C 1911 nt5.26□□□□□ -1.57
UBP1P25037 TRF5YNL299W 1929 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 CTR86YCR054C 1692 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 Q0032Q0032 291 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YDR115WYDR115W 318 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 HOM2YDR158W 1098 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 LPP1YDR503C 825 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 SOL4YGR248W 768 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YIR020CYIR020C 303 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 EFB1YAL003W 621 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 MAK16YAL025C 921 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YKL044WYKL044W 321 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YPL225WYPL225W 441 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 DER1YBR201W 636 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 TPO5YKL174C 1857 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 GDI1YER136W 1356 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 ADY4YLR227C 1482 nt5.25□□□□□ -1.57
UBP1P25037 PBS2YJL128C 2007 nt5.24□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YLR152CYLR152C 1731 nt5.24□□□□□ -1.57
UBP1P25037 YDR193WYDR193W 399 nt5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35 ms