Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Htr3aP23979 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr3aP23979 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms