Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou5f1P20263 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157 ms