Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vpreb1P13372 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vpreb1P13372 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms