Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PolP11369 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PolP11369 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PolP11369 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PolP11369 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PolP11369 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms