Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2P10911 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2P10911 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2P10911 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2P10911 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2P10911 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2P10911 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2P10911 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2P10911 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2P10911 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2P10911 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2P10911 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2P10911 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2P10911 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms