Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Schip1P0DPB4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Schip1P0DPB4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms