Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxb5P09079 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Hoxb5P09079 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Hoxb5P09079 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxb5P09079 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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