Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcrg-V1P06325 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcrg-V1P06325 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms