Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOD2P04179 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOD2P04179 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOD2P04179 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOD2P04179 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOD2P04179 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOD2P04179 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOD2P04179 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOD2P04179 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOD2P04179 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms