Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntsr1O88319 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntsr1O88319 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms