Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ImpactO55091 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ImpactO55091 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ImpactO55091 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ImpactO55091 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ImpactO55091 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ImpactO55091 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ImpactO55091 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ImpactO55091 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ImpactO55091 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ImpactO55091 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms