Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3tc1G3X9F6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3tc1G3X9F6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3tc1G3X9F6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms